激光会有副作用吗？
这个问题让我来回答你！ 答主本人就是做激光的，每天都得近距离观看激光器，偶尔还需要用手触摸（做实验）。不过我接触的是固体激光器，而题主说的是脉冲激光。所以可能有些内容对题主来说比较晦涩。不过还是希望能帮助到题主。
首先来了解一下什么叫做激光吧！激光的全称是“Laser”，这个单词最开始是于1958年由前苏联科学院院长亚历山大·谢尔盖耶维奇·波波夫博士所创造的。
用通俗一点的话来讲，激光就是一个非常强大的发信号的工具。通过向介质里注入电荷或者磁荷产生共振，从而让这些介质发出我们视觉器官可以理解的光——电磁波。 这个过程和放大镜的原理是非常类似的。都是将小面积的光源进行放大，最后形成我们可以观察到的光。只不过放大镜是用光的直线传播放大的，而激光是利用了振荡放大。
而我们常用的手术刀、眼科激光治疗仪等等用的都是激光的物理特性：相干光源&高能量密度。 相干光源简单来说就是每一个光子都有固定的频率，这样它们互相碰撞就可以发生干涉的现象。而这种特征正好可以用来标记和切削目标物质。
以近视眼手术为例。通常现在都是采用准分子激光来手术。准分子激光是一种冷激光，它的能量很低，不足以加热角膜使它变形。因此它是利用了相干光源的特性，先用激光在角膜上打出一条细小的槽，再用机械工具刮去槽里的神经末梢。因为每一条神经末梢都是独立的，所以不会导致神经末梢全部死亡，也就不会出现失明的症状。
至于你说到的副作用，我想应该是来自两个部分。一个是激光本身具有的热效应，另外一部分可能是你对这种新的事物的不适应感。 热效应不用说，任何高温都会对我们人体造成一定的伤害。不过激光的温度控制得非常的好，可以在百万分之一秒之内调整输出功率。因此几乎没有热量能传到眼睛里面。不过毕竟还是有微波存在，如果频繁使用，还是有可能破坏眼角膜上的微纤结构，影响视力的。
至于你不适应的感觉，那应该就是强光刺激引起的不适感。毕竟人眼是构造精密的感知器官。对于强光的反应也是很灵敏的。